软件安装
Contents
软件安装#
安装方式#
Linux 或 macOS 系统下安装软件通常有如下几种方式：
使用系统自带的应用商店（App Store）在图形界面下安装软件
使用软件包管理器通过命令行安装软件。例如，Ubuntu/Debian 的
apt、 Fedora 的dnf、macOS 的brew。这些软件包管理器既可以安装 官方源提供的软件，也可以安装可信赖的第三方源提供的软件直接下载闭源软件或商业软件提供的二进制包进行安装，如 Linux 下的
deb和rpm、macOS 下的dmg某个编程语言的包，通常可以使用该编程语言自带的包管理工具进行安装，比如 Python 语言的包管理器
conda和pip某些软件提供了二进制的压缩包，则解压后直接放在某个目录，然后修改环境变量 PATH 即可使用
下载软件源码、编译并安装
绝大多数非科研类开源软件都可以通过方式 1–3 安装；多数闭源软件或商业软件
都可以通过方式 1–3 和方式 5 安装；对于地震学科研软件而言，
通常可以通过方式 4（很多地震学软件是用 Python 语言写的，因而可以通过 conda
或 pip 安装）、方式 5 或方式 6 进行安装。
方式 1–4 会将软件安装到默认的位置，通常用户无法控制，也无需关心其具体安装位置。 而对于方式 5 和 6，用户可选择将软件安装到任意位置。为了便于安装与管理科研 相关软件，我们总结了如下实践经验。
安装路径#
软件安装相关的路径如下：
~/software/：存放软件的原始压缩包~/opt/：解压即用的软件、需源码编译并安装的软件~/src/：需源码编译的软件（含需源码编译并安装软件的源码目录）~/bin/：简单的小工具软件，如单个源码文件编译链接后生成的可执行文件、 单个可执行文件以及工具型脚本/opt/：大多数闭源软件或商业软件、某些与地震学科研无关的软件、ARM 架构 macOS 下的 Homebrew
软件包#
软件的原始压缩包可以保存在 ~/software/ 目录下，相当于做一个备份，
如 ~/software/TauP-2.4.5.tgz。
解压即用的软件#
某些软件提供了二进制包，可以解压即用，可安装在 ~/opt/ 的子目录下，
如 ~/opt/TauP。
从源码编译的软件#
需要从源码编译的软件，可将源码目录放在 ~/src/ 的子目录下，如 ~/src/fk、
~/src/GMT、~/src/distaz。
若该软件不需安装，则编译链接后生成的可执行文件在该软件目录下或其子目录 bin 下，
如 ~/src/fk、~/src/CPS/bin。如果该软件只是一个简单的小工具，
比如单个源码文件或单个可执行文件，则可以将生成的可执行文件复制至 ~/bin/ 目录下，
如 ~/bin/distaz。
若该软件编译后需要安装，可安装在 ~/opt/ 的子目录下，如 ~/opt/GMT。
闭源或商业软件#
大多数闭源软件或商业软件可安装到 /opt/ 的子目录下，如 Matlab、Intel 编译器等。
一般这也是闭源软件或商业软件的默认安装路径。某些与地震学科研无关的软件，比如
文献管理软件 Mendeley 和 Zotero 均可安装到任意路径，也建议安装到 /opt/ 目录下。
关于 ~/opt/ 的说明#
这里推荐将科研相关软件安装到 ~/opt/ 目录下，而不是更常见的 /opt/
或 /usr/local/ 目录，主要是基于如下几点考虑：
某些包管理器使用了这些目录，比如非 ARM 架构 macOS 下的 Homebrew 的软件安装路径是
/usr/local/，macOS 的 MacPorts 的软件安装路径是/opt/local/。 历史上，该目录主要用于放置在本地编译并另行安装的程序，避免和/usr/目录下的系统自带版本冲突/opt/目录一般用于安装非系统自带的、第三方预先编译并发行的独立软件包。 例如，某些闭源或商业软件（如 Matlab、Google Chrome、Google Earth）默认将软件 安装到/opt/目录下。ARM 架构 macOS 下的 Homebrew 也被安装到该目录下地震学科研软件与其他软件属于不同的两类软件，因而将二者放在不同的目录下更合理
对于使用服务器的用户而言，通常没有权限在
/opt/或/usr/local/等 目录安装软件，因而服务器用户必须在家目录下安装软件。设定软件安装在~/opt/下使得用户在个人电脑和服务器上可以有完全相同的目录结构将所有科研相关软件的源码及二进制文件都放在家目录下，使得备份和还原变得更简单
基于以上理由，推荐将地震学科研软件安装在 ~/opt/ 目录下。